Theo kết quả nghiên cứu, vịnh Nha Trang có diện tích khoảng 420 km2, là một trong những hình mẫu tự nhiên hiếm có của hệ thống vũng, vịnh trên thế giới.

Theo kết quả nghiên cứu, vịnh Nha Trang có diện tích khoảng 420 km2, là một trong những hình mẫu tự nhiên hiếm có của hệ thống vũng, vịnh trên thế giới.

Vịnh Nha Trang có hầu hết các hệ sinh thái điển hình, quý hiếm của vùng biển nhiệt đới và có tầm quan trọng quốc tế. Đó là hệ sinh thái đất ngập nước, rạn san hô, rừng ngập mặn, thảm cỏ biển, hệ sinh thái cửa sông, hệ sinh thái đảo biển, hệ sinh thái bãi cát ven bờ... Các hệ sinh thái này có nhiều chức năng quý giá. Bảo vệ môi trường là nơi cư trú, sinh sản, vỗ béo và ương nuôi... các thủy sinh vật, là giá đỡ và kè biển tự nhiên phòng chống bão tố, xói lở, bồi tụ đường bờ... Vịnh Nha Trang có hơn 350 loài cá cảnh biển, khoảng 350 loài san hô (có cả san hô đỏ, rất quý hiếm). Bước đầu xác định vịnh Nha Trang có hơn 600 loài hải sản, mỗi năm có thể khai thác hàng trăm tấn.

Theo quan điểm sinh thái - kinh tế, vịnh Nha Trang là nơi hội tụ đầy đủ một cách kỳ lạ tất cả những yếu tố để phát triển 5 trong 6 ngành kinh tế biển quan trọng như:  Cảng biển, giao thông vận tải hàng hải, nghề cá - nuôi trồng hải đặc sản, trải nghiệm - nghỉ dưỡng - giải trí trên …

Vịnh Nha Trang không chỉ giàu tài nguyên, đẹp cảnh quan, mà còn gắn liền với những nét đẹp của văn hóa biển và những khu văn hóa - chương trình như: Tháp Bà Ponagar, Bảo tàng A.Yersin, Viện Pasteur Nha Trang, Viện Hải dương học, Bảo tàng Hải dương học lớn nhất Đông Dương... Hiện vịnh Nha Trang đã được công nhận là thành viên Câu lạc bộ các vịnh đẹp nhất thế giới & là danh thắng quốc gia .

Một trong những thế mạnh hành trình của vịnh Nha Trang là hệ thống các đảo đa dạng, nhiều đảo đẹp cả cảnh quan trên bờ và dưới nước. Vì vậy, trải nghiệm tuyến đảo ở đây có nhiều sản phẩm độc đáo.Đầu tiên phải nói đến Hòn Mun, khu bảo tồn biển đầu tiên ở Việt Nam. Nơi đây có những rạn san hô với quần thể sinh vật biển còn nguyên sơ, gần như có một không hai của Việt Nam và Ðông Nam Á. Ưu tiên hàng đầu Hòn Mun là bảo tồn đa dạng sinh học và Phát triển Lữ Hành gắn liền với các hoạt động chương trình sinh thái.

Điểm đến nổi tiếng thứ hai là Vinpearl Land Nha Trang trên đảo Hòn Tre. Bên cạnh hệ thống khách sạn 5 sao đẳng cấp quốc tế, Vinpearl Land Nha Trang có công viên giải trí với nhiều công trình hiện đại, đặc sắc, sánh ngang với các công viên giải trí hàng đầu của các nước trong khu vực và trên thế giới: Cáp treo vượt biển dài nhất thế giới (3.320 m), công viên nước diện tích 60.000 m2, thủy cung diện tích 3.400 m2, với 300 loài sinh vật biển quý hiếm, lạ mắt; sân khấu nhạc nước và biểu diễn ngoài trời, với sức chứa hơn 5.000 chỗ...

Là một trong những nét đặc sắc Của tuyến đảo vịnh Nha Trang là tham quan đảo yến. Từ TP.Nha Trang, Lữ khách đi tàu biển khoảng 20 hải lý sẽ đến Hòn Nội. Tại đây, khách thăm quan sẽ tham quan hang yến, tận mắt thấy chim yến làm tổ trên vách đá, du ngoạn trên tàu đáy kính ngắm thảm sinh vật kỳ diệu được tạo nên bởi san hô, rong biển, cỏ biển... Mới đây, khu nghỉ dưỡng đảo yến Đông Tằm (ở phía đông đảo Hòn Tằm) đã được khai trương,  với các dịch vụ tham quan hang yến, leo núi, trò chơi trên biển như:  lướt ván, mô tô nước, lặn biển ngắm san hô...

Bên cạnh đó, tuyến đảo vịnh Nha Trang còn có nhiều khu thăm quan, điểm tham quan khác như: khu nghỉ dưỡng Hòn Tằm, Hòn Một, hồ cá - thủy cung Trí Nguyên... Theo quy hoạch tổng thể Phát triển Lữ Hành Khánh Hòa đến năm 2020, khu vực vịnh Nha Trang (bao gồm phần đất liền dọc bờ vịnh và các đảo nằm trong khu vực vịnh) sẽ trở thành một trong những khu thăm quan biển hàng đầu của Việt Nam.